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新研究可有效預(yù)測胃癌腹膜轉(zhuǎn)移的標(biāo)志物
[所屬分類:行業(yè)動態(tài)] [發(fā)布時間:2025-1-17] [發(fā)布人:楊曉燕] [閱讀次數(shù):] [返回]
新研究可有效預(yù)測胃癌腹膜轉(zhuǎn)移的標(biāo)志物
作者:朱漢斌 來源:中國科學(xué)報
山東拓普生物工程有限公司 http://qp8008.cn
中山大學(xué)腫瘤防治中心胃外科副主任醫(yī)師李元方/聶潤聰團(tuán)隊研究探索了長鏈非編碼RNA(lncRNA)在胃癌腹膜轉(zhuǎn)移中的轉(zhuǎn)錄景觀及其預(yù)測潛力,構(gòu)建了基于lncRNA的胃癌腹膜復(fù)發(fā)預(yù)測系統(tǒng),并發(fā)現(xiàn)CASC15可通過激活JNK和p38信號通路促進(jìn)胃癌細(xì)胞的遷移和侵襲,可作為胃癌腹膜轉(zhuǎn)移新的治療靶點(diǎn)。2024年12月31日,相關(guān)成果在線發(fā)表于《分子癌癥》(Molecular Cancer)。
胃癌是我國最常見的惡性腫瘤之一,根據(jù)2022年我國癌癥研究中心報告,胃癌的發(fā)病率在惡性腫瘤中排名第5位,占所有新發(fā)惡性腫瘤的7.4%,胃癌相關(guān)死亡人數(shù)在惡性腫瘤中排名第3位,占總體腫瘤死亡人數(shù)的10.1%。由于早期胃癌缺乏典型癥狀,大部分患者在診斷時已經(jīng)處于進(jìn)展期甚至出現(xiàn)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。腹膜是胃癌遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移及術(shù)后復(fù)發(fā)的常見部位,預(yù)后差,而且常規(guī)CT和PET/CT等方式診斷腹膜轉(zhuǎn)移的效果欠佳,漏診率達(dá)20-30%。因此,如何精準(zhǔn)識別甚至預(yù)測胃癌腹膜轉(zhuǎn)移極具臨床意義。
為了解決這一臨床難題,研究團(tuán)隊組建了涵蓋腫瘤外科、生物信息、基礎(chǔ)研究的多學(xué)科聯(lián)合攻關(guān)團(tuán)隊,從胃癌腹膜轉(zhuǎn)移患者配對的胃癌原發(fā)灶、腹膜轉(zhuǎn)移灶以及正常胃黏膜上皮組織的lncRNA轉(zhuǎn)錄組譜入手,通過231例中山大學(xué)腫瘤防治中心胃癌患者數(shù)據(jù)與414例癌癥基因組圖譜(TCGA)胃癌患者數(shù)據(jù)雙隊列共同識別關(guān)鍵lncRNA,構(gòu)建腹膜復(fù)發(fā)預(yù)測模型,并進(jìn)一步通過體內(nèi)體外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證其背后的理論依據(jù)。
研究團(tuán)隊通過LASSO回歸模型篩選出5個關(guān)鍵lncRNA(CASC15、CH17-360D5.2、LINC01094、MIR4435-2HG、RP11-400N13.3),并構(gòu)建腹膜轉(zhuǎn)移評分,該評分可有效預(yù)測胃癌患者的無腹膜復(fù)發(fā)生存率、無復(fù)發(fā)生存率以及生存率。隨后,通過整合臨床病理信息,構(gòu)建綜合評分模型,進(jìn)一步提高了其對無腹膜復(fù)發(fā)生存率的預(yù)測效能,5年pRFS(無腹膜復(fù)發(fā)生存期)的AUC達(dá)0.79。
為了進(jìn)一步探索該預(yù)測能力背后的機(jī)制,探索lncRNA在胃癌腹膜轉(zhuǎn)移的作用,研究團(tuán)隊針對CASC15進(jìn)行深入研究,通過體外和體內(nèi)多維度實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證CASC15在胃癌腹膜轉(zhuǎn)移中的關(guān)鍵作用。此外,血漿的CASC15水平具備作為液體活檢標(biāo)志物診斷胃癌腹膜轉(zhuǎn)移的潛力。機(jī)制研究表明,CASC15主要通過激活JNK和p38信號通路促進(jìn)上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)移。
該研究通過轉(zhuǎn)錄組分析和生物信息學(xué)方法,結(jié)合大樣本的臨床數(shù)據(jù),成功識別并驗(yàn)證了與胃癌腹膜復(fù)發(fā)相關(guān)的關(guān)鍵lncRNA,首次構(gòu)建了一個基于lncRNA的預(yù)測胃癌患者腹膜轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā)風(fēng)險模型,并為個體化治療提供了新的思路。
該研究還揭示了CASC15促進(jìn)胃癌腹膜轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制,并發(fā)現(xiàn)其作為液體活檢標(biāo)記物的潛能,具有重要的臨床應(yīng)用潛力。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1186/s12943-024-02196-4
(本文內(nèi)容來源于網(wǎng)絡(luò),版權(quán)歸原作者所有,如有侵權(quán)可后臺聯(lián)系刪除。)
作者:朱漢斌 來源:中國科學(xué)報
山東拓普生物工程有限公司 http://qp8008.cn
中山大學(xué)腫瘤防治中心胃外科副主任醫(yī)師李元方/聶潤聰團(tuán)隊研究探索了長鏈非編碼RNA(lncRNA)在胃癌腹膜轉(zhuǎn)移中的轉(zhuǎn)錄景觀及其預(yù)測潛力,構(gòu)建了基于lncRNA的胃癌腹膜復(fù)發(fā)預(yù)測系統(tǒng),并發(fā)現(xiàn)CASC15可通過激活JNK和p38信號通路促進(jìn)胃癌細(xì)胞的遷移和侵襲,可作為胃癌腹膜轉(zhuǎn)移新的治療靶點(diǎn)。2024年12月31日,相關(guān)成果在線發(fā)表于《分子癌癥》(Molecular Cancer)。
胃癌是我國最常見的惡性腫瘤之一,根據(jù)2022年我國癌癥研究中心報告,胃癌的發(fā)病率在惡性腫瘤中排名第5位,占所有新發(fā)惡性腫瘤的7.4%,胃癌相關(guān)死亡人數(shù)在惡性腫瘤中排名第3位,占總體腫瘤死亡人數(shù)的10.1%。由于早期胃癌缺乏典型癥狀,大部分患者在診斷時已經(jīng)處于進(jìn)展期甚至出現(xiàn)遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。腹膜是胃癌遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移及術(shù)后復(fù)發(fā)的常見部位,預(yù)后差,而且常規(guī)CT和PET/CT等方式診斷腹膜轉(zhuǎn)移的效果欠佳,漏診率達(dá)20-30%。因此,如何精準(zhǔn)識別甚至預(yù)測胃癌腹膜轉(zhuǎn)移極具臨床意義。
為了解決這一臨床難題,研究團(tuán)隊組建了涵蓋腫瘤外科、生物信息、基礎(chǔ)研究的多學(xué)科聯(lián)合攻關(guān)團(tuán)隊,從胃癌腹膜轉(zhuǎn)移患者配對的胃癌原發(fā)灶、腹膜轉(zhuǎn)移灶以及正常胃黏膜上皮組織的lncRNA轉(zhuǎn)錄組譜入手,通過231例中山大學(xué)腫瘤防治中心胃癌患者數(shù)據(jù)與414例癌癥基因組圖譜(TCGA)胃癌患者數(shù)據(jù)雙隊列共同識別關(guān)鍵lncRNA,構(gòu)建腹膜復(fù)發(fā)預(yù)測模型,并進(jìn)一步通過體內(nèi)體外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證其背后的理論依據(jù)。
研究團(tuán)隊通過LASSO回歸模型篩選出5個關(guān)鍵lncRNA(CASC15、CH17-360D5.2、LINC01094、MIR4435-2HG、RP11-400N13.3),并構(gòu)建腹膜轉(zhuǎn)移評分,該評分可有效預(yù)測胃癌患者的無腹膜復(fù)發(fā)生存率、無復(fù)發(fā)生存率以及生存率。隨后,通過整合臨床病理信息,構(gòu)建綜合評分模型,進(jìn)一步提高了其對無腹膜復(fù)發(fā)生存率的預(yù)測效能,5年pRFS(無腹膜復(fù)發(fā)生存期)的AUC達(dá)0.79。
為了進(jìn)一步探索該預(yù)測能力背后的機(jī)制,探索lncRNA在胃癌腹膜轉(zhuǎn)移的作用,研究團(tuán)隊針對CASC15進(jìn)行深入研究,通過體外和體內(nèi)多維度實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證CASC15在胃癌腹膜轉(zhuǎn)移中的關(guān)鍵作用。此外,血漿的CASC15水平具備作為液體活檢標(biāo)志物診斷胃癌腹膜轉(zhuǎn)移的潛力。機(jī)制研究表明,CASC15主要通過激活JNK和p38信號通路促進(jìn)上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)移。
該研究通過轉(zhuǎn)錄組分析和生物信息學(xué)方法,結(jié)合大樣本的臨床數(shù)據(jù),成功識別并驗(yàn)證了與胃癌腹膜復(fù)發(fā)相關(guān)的關(guān)鍵lncRNA,首次構(gòu)建了一個基于lncRNA的預(yù)測胃癌患者腹膜轉(zhuǎn)移復(fù)發(fā)風(fēng)險模型,并為個體化治療提供了新的思路。
該研究還揭示了CASC15促進(jìn)胃癌腹膜轉(zhuǎn)移的分子機(jī)制,并發(fā)現(xiàn)其作為液體活檢標(biāo)記物的潛能,具有重要的臨床應(yīng)用潛力。
相關(guān)論文信息:https://doi.org/10.1186/s12943-024-02196-4
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