[所屬分類:新聞動態(tài)] [發(fā)布時間:2020-6-28] [發(fā)布人:] [閱讀次數(shù):] [返回]

山東拓普生物工程有限公司

Shandong Tuopu Biol-Engineering Co.,Ltd

在過去的15年中，通過在分子水平上識別癌癥的驅(qū)動因素，對腫瘤基因組進行測序的能力徹底改變了癌癥的治療方法。但是，由于當前基因組測序的局限性，了解腫瘤中單個細胞的遺傳多樣性以及如何影響疾病進展仍然是一個挑戰(zhàn)。

USC研究人員使用基于微流體滴的單細胞測序方法，同時對近1,500個單細胞的基因組進行了測序，揭示了先前隱藏在經(jīng)過充分研究的黑素瘤細胞系中的遺傳多樣性。

這項剛剛發(fā)表的研究證明了單細胞測序揭示癌細胞可能進化軌跡的能力。

“我們用這種方法來檢查標準的癌細胞系，由許多不同的實驗室檢查上千次，”大衛(wèi)·克雷格，博士，在共同的主任說翻譯基因組研究所在南加州大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Keck醫(yī)學(xué)院和研究的主要作者。“真正令人驚訝的是，借助這項技術(shù)，我們發(fā)現(xiàn)了我們所料想不到的復(fù)雜性。該生產(chǎn)線實際上一直是各種類型細胞的混合物。重新檢查該生產(chǎn)線數(shù)十年的工作-現(xiàn)在有了這些新信息-我們有了新的對腫瘤進化的見解�！�

高分辨率查看癌癥的復(fù)雜性

當前，通常通過一起而不是單獨地對數(shù)百萬個腫瘤細胞進行測序來獲得腫瘤的遺傳信息。盡管這種方法提供了組織遺傳構(gòu)成的廣闊視野，但它可能會錯過腫瘤中與大多數(shù)細胞不同的少量癌細胞。

使用其他分析單個細胞DNA的方法，該過程非常費力，僅花費數(shù)周時間即可處理少量細胞，并且需要大多數(shù)實驗室所沒有的資源。

在這項研究中，研究人員使用了一種新興技術(shù)，稱為“單細胞拷貝數(shù)分析”。由10X Genomics開發(fā)的新型分析方法，將這些結(jié)果與歷史方法相結(jié)合。

凱克學(xué)院翻譯基因組學(xué)的首席作者兼助理教授恩里克·維拉克斯奎茲·維拉雷爾(Enrique Velazquez-Villarreal)博士說：“我們沒有分析平均要分析成千上萬個細胞的組織DNA，而是在一個實驗中分析了將近1500個細胞的單個DNA。”南加州大學(xué)醫(yī)學(xué)系�！耙赃@種較高的分辨率研究癌癥，我們可以發(fā)現(xiàn)低分辨率的批量測序遺漏的信息�！�

他們的分析顯示，至少有四個主要的細胞亞群(也稱為克隆)，有望在癌細胞系進化的某個時候從原始癌細胞發(fā)生突變。

在癌癥組織中鑒定亞克隆的能力可以提供重要的生物學(xué)見解，以了解癌癥如何發(fā)展，如何擴散以及為什么會對治療產(chǎn)生抵抗力。