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多種養(yǎng)殖哺乳動物攜帶的病毒基因組遺傳多樣性被解碼
[所屬分類:行業(yè)動態(tài)] [發(fā)布時間:2024-9-11] [發(fā)布人:楊曉燕] [閱讀次數(shù):] [返回]
多種養(yǎng)殖哺乳動物攜帶的病毒基因組遺傳多樣性被解碼
作者：江慶齡 來源：科學網(wǎng)
山東拓普生物工程有限公司 http://qp8008.cn
復旦大學公共衛(wèi)生學院教授粟碩團隊與中國科學院微生物研究所研究員畢玉海等合作者，揭示了多種哺乳動物宏基因組數(shù)據(jù)中的病毒基因組組成、生態(tài)學特征與潛在跨物種傳播風險，為構(gòu)建“人-動物-環(huán)境”一體化、多維度新發(fā)傳染病預測預警體系奠定了重要數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。9月4日，相關(guān)研究發(fā)表于《自然》。
21世紀以來，人類多次經(jīng)歷由動物源新發(fā)傳染病原引發(fā)的大流行疫情。據(jù)報道，超過70%的人畜共患疾病源自野生動物。同時國內(nèi)外大量研究提示，部分養(yǎng)殖哺乳動物如水貂等可能具有攜帶人獸共患病毒的潛力。然而除傳統(tǒng)家畜外，養(yǎng)殖哺乳動物的病原生態(tài)學與流行病學數(shù)據(jù)存在較大空白，制約了新發(fā)傳染病疫情的精準防控。
研究團隊對5個動物目的哺乳動物進行了系統(tǒng)的宏基因組研究，鑒定到125種病毒基因組，其中39種可推定為新的病毒種。進一步地，研究人員遴選出諾如病毒、蓋塔病毒等多種頻繁發(fā)生“宿主跳躍”的潛在“風險”病毒，對其潛在跨物種傳播風險進行解析，并從空間聚類、動物類群、種群、組織等維度揭示了這些病毒的生態(tài)學與流行病學特征。
為在個體水平解析病毒共感染，同時更靈敏地挖掘低豐度病毒，團隊設(shè)計了單組織單樣本的建庫策略，在166個單組織文庫里鑒定到2種以上病毒。結(jié)果表明，星狀病毒、細小病毒等與其他病毒頻繁發(fā)生共感染。此外，研究人員對低豐度病毒片段進行精準拼接，避免了真陽性病毒因豐度閾值而被過濾，實現(xiàn)了多個病毒基因組90%的完成度。
“我們希望填補當前對動物攜帶微生物的認知空白，尤其是養(yǎng)殖哺乳動物�！彼诖T表示，“如果能提前監(jiān)測和預報對人類和家畜構(gòu)成潛在威脅的病毒，并部署包括動物疫苗研發(fā)在內(nèi)的綜合防控措施，將對于新發(fā)傳染病關(guān)口前移、保障生命健康至關(guān)重要�！�
相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1038/s41586-024-07901-3
（本文內(nèi)容來源于網(wǎng)絡，版權(quán)歸原作者所有，如有侵權(quán)可后臺聯(lián)系刪除。）
作者：江慶齡 來源：科學網(wǎng)
山東拓普生物工程有限公司 http://qp8008.cn
復旦大學公共衛(wèi)生學院教授粟碩團隊與中國科學院微生物研究所研究員畢玉海等合作者，揭示了多種哺乳動物宏基因組數(shù)據(jù)中的病毒基因組組成、生態(tài)學特征與潛在跨物種傳播風險，為構(gòu)建“人-動物-環(huán)境”一體化、多維度新發(fā)傳染病預測預警體系奠定了重要數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。9月4日，相關(guān)研究發(fā)表于《自然》。
21世紀以來，人類多次經(jīng)歷由動物源新發(fā)傳染病原引發(fā)的大流行疫情。據(jù)報道，超過70%的人畜共患疾病源自野生動物。同時國內(nèi)外大量研究提示，部分養(yǎng)殖哺乳動物如水貂等可能具有攜帶人獸共患病毒的潛力。然而除傳統(tǒng)家畜外，養(yǎng)殖哺乳動物的病原生態(tài)學與流行病學數(shù)據(jù)存在較大空白，制約了新發(fā)傳染病疫情的精準防控。
研究團隊對5個動物目的哺乳動物進行了系統(tǒng)的宏基因組研究，鑒定到125種病毒基因組，其中39種可推定為新的病毒種。進一步地，研究人員遴選出諾如病毒、蓋塔病毒等多種頻繁發(fā)生“宿主跳躍”的潛在“風險”病毒，對其潛在跨物種傳播風險進行解析，并從空間聚類、動物類群、種群、組織等維度揭示了這些病毒的生態(tài)學與流行病學特征。
為在個體水平解析病毒共感染，同時更靈敏地挖掘低豐度病毒，團隊設(shè)計了單組織單樣本的建庫策略，在166個單組織文庫里鑒定到2種以上病毒。結(jié)果表明，星狀病毒、細小病毒等與其他病毒頻繁發(fā)生共感染。此外，研究人員對低豐度病毒片段進行精準拼接，避免了真陽性病毒因豐度閾值而被過濾，實現(xiàn)了多個病毒基因組90%的完成度。
“我們希望填補當前對動物攜帶微生物的認知空白，尤其是養(yǎng)殖哺乳動物�！彼诖T表示，“如果能提前監(jiān)測和預報對人類和家畜構(gòu)成潛在威脅的病毒，并部署包括動物疫苗研發(fā)在內(nèi)的綜合防控措施，將對于新發(fā)傳染病關(guān)口前移、保障生命健康至關(guān)重要�！�
相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1038/s41586-024-07901-3
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