[所屬分類:行業(yè)動(dòng)態(tài)] [發(fā)布時(shí)間:2024-3-29] [發(fā)布人:邵玉倩] [閱讀次數(shù):] [返回]

狗牙根屬起源與耐鹽候選基因研究有了新突破
作者：計(jì)紅梅，薛春燕，季文豪   來(lái)源：中國(guó)科學(xué)報(bào)
山東拓普生物工程有限公司  http://qp8008.cn
近日，青島農(nóng)業(yè)大學(xué)/魯東大學(xué)傅金民課題組與美國(guó)俄克拉荷馬州立大學(xué)吳彥奇課題組、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)張建偉課題組合作，在《植物雜志》（The Plant Journal）上發(fā)表最新研究成果。該研究構(gòu)建了異源四倍體狗牙根（Cynodon dactylon）的參考基因組，揭示了其起源，并發(fā)掘了三個(gè)關(guān)鍵的耐鹽基因。
狗牙根是一種全球分布廣泛、廣泛使用的暖季型草坪草和牧草，對(duì)多種非生物脅迫（如鹽堿、踐踏、高溫和干旱）具有抗性，并且?guī)缀蹩梢栽谒�有土壤類型中良好生長(zhǎng)，具有重要的經(jīng)濟(jì)和生態(tài)價(jià)值。然而，四倍體狗牙根的遺傳背景復(fù)雜，其基因組研究相對(duì)落后，導(dǎo)致其起源和耐鹽機(jī)制的關(guān)鍵點(diǎn)尚未充分闡明。因此，獲取狗牙根的基因組資源對(duì)于品種改良和耐鹽機(jī)制的解析具有重要意義。
傅金民課題組結(jié)合前期對(duì)狗牙根種質(zhì)遺傳多樣性的研究、高效穩(wěn)定的遺傳轉(zhuǎn)化平臺(tái)建立以及優(yōu)良品種的培育，對(duì)狗牙根進(jìn)行了系統(tǒng)性的研究。研究團(tuán)隊(duì)首先成功構(gòu)建了普通四倍體狗牙根“A12359”的單倍體基因組，其大小為604.03 Mb，包含18條染色體和2套完整的同源染色體，每套約含3萬(wàn)個(gè)基因。其次通過(guò)系統(tǒng)發(fā)育分析，揭示了狗牙根屬與復(fù)活草分化于大約19.7-25.4百萬(wàn)年前，而狗牙根的兩套亞基因組在非洲大陸約于6.3–9.1百萬(wàn)年前分化�；�因家族聚類分析表��，虎尾草亞科中共有12319個(gè)基因家族，其中狗牙根特有的基因家族有1533個(gè)。再者，通過(guò)進(jìn)一步的基因組研究揭示了狗牙根的祖先基因順序、倍性增加相關(guān)的基因共線性模式和基因組演化特性。Ks分析顯示，狗牙根在約1.5百萬(wàn)年前形成了異源四倍體。最后，通過(guò)全基因組SNP和耐鹽性相關(guān)的表型數(shù)據(jù)的GWAS分析，鑒定出與六個(gè)農(nóng)藝性狀相關(guān)的82個(gè)候選基因，其中三個(gè)SNP與耐鹽基因RAP2-2、CNG通道和F14D7.1有強(qiáng)烈關(guān)聯(lián)，這些基因可能與狗牙根的耐鹽性增強(qiáng)有關(guān)。
業(yè)內(nèi)人士表示，這項(xiàng)研究為普通狗牙根的遺傳背景和起源提供了清晰的認(rèn)識(shí)。這些發(fā)現(xiàn)將有助于深入揭示狗牙根耐鹽性的分子機(jī)制。鑒定的耐鹽基因在新品種培育中具有重要應(yīng)用價(jià)值。
相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1111/tpj.16729
（本文內(nèi)容來(lái)源于網(wǎng)絡(luò)，版權(quán)歸原作者所有，如有侵權(quán)可后臺(tái)聯(lián)系刪除。）